Differenza tra upstream e DNA downstream | Upstream vs Downstream DNA

Differenza chiave - Upstream vs DNA downstream

È importante avere una conoscenza generale sulla composizione e struttura del DNA per comprendere la differenza tra il DNA a monte e verso il basso. Il DNA è composto da catene polinucleotidiche. I nucleotidi sono i blocchi che creano catene polinucleotidi e ogni nucleotide è costituito da tre componenti: uno zucchero a cinque carbonio, una base azotata e un gruppo fosfato. Un gruppo fosfato e un gruppo OH sono collegati, rispettivamente, al carbonio posizionato a 5 'e al carbonio 3' della molecola di zucchero in un nucleotide. I nucleotidi sono raggruppati da legami di fosfodiestere formati tra 5 'gruppo fosfato di un nucleotide e 3' gruppo OH del nucleotide adiacente. Se una catena di polinucleotidi presenta un gruppo di fosfato libero di 5 ', viene assegnato come estremità 5'; se ha un gruppo libero 3 'OH, viene assegnato come un 3' fine. Pertanto, i fili del DNA hanno solitamente 5 'e 3' estremità secondo le posizioni di fine delle catene polinucleotidi. Il DNA esiste anche come forma a doppio filamento. Due fili sono antiparalleli tra di loro. Pertanto, il DNA ha due fili che corrono verso 5 'a 3' direzione e 3 'a 5' direzione. Il DNA a monte ea valle viene indicato con riferimento alla trascrizione e alla sintesi di un filamento mRNA da 5 'a 3'. Se il DNA è considerato verso l'estremità 5 del filo di codifica dal sito di inizio della trascrizione è conosciuto come DNA a monte. Se il DNA viene considerato verso l'estremità 3 'dal filo di codifica dal sito di inizio della trascrizione è noto come DNA downstream . Questa è la differenza fondamentale tra il DNA a valle e verso il basso.

SOMMARIO

1. Panoramica e differenza chiave

2. Che cosa è il DNA a monte

3. Che cosa è DNA downstream

4. Confronto laterale - verso l'alto rispetto al DNA downstream

5. Sommario

Che cosa è il DNA Upstream?

Un gene è un'eredità strutturale e funzionale che si trova sul DNA di un organismo. Viene conservato con le istruzioni per costruire una proteina. Il gene ha una regione specifica di una molecola del DNA. Se richiesto, esso trascrive e traduce in una proteina attraverso la sintesi di un filamento mRNA. Normalmente un filo di codifica del gene scorre da 5 'a 3' direzione. Quando viene trascritto, produce una fascia mRNA nella stessa direzione da 5 'a 3'. Durante la trascrizione, il filo antisenso da 3 'a 5' viene utilizzato come filo di template e inizia la sintesi di mRNA. C'è un sito di inizio della trascrizione nel gene. Con riferimento al sito di inizio della trascrizione, la regione del DNA verso l'estremità 5 'del filo di codifica è conosciuta come DNA a monte.Un promotore del gene è normalmente localizzato nella regione a monte del DNA. Nei geni eucariotici ci sono scatole TATA, elementi proximal del promotore e enhancers nella zona a monte del gene. La regione a monte del gene è riferita a numeri negativi. Il DNA a monte di un gene è di massima importanza per la trascrizione.

Che cosa è il DNA a valle?

Il sito di inizio della trascrizione è conosciuto come +1 punto di un gene. La regione del DNA da +1 punto verso l'estremità 3 'del filo di codifica è conosciuta come DNA a valle. In altre parole, a valle del gene è dal sito di inizio della trascrizione verso l'estremità 5 'del filo di template. Pertanto, il DNA a valle di una regione genica comprende unità trascrizionali e altre sequenze come la sequenza di terminatori. Il promotore può influenzare la sequenza a valle di un gene. La parte a valle di un gene è riferita a numeri positivi. Il DNA a valle di un gene è la regione reale che fornisce il prodotto proteico.

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Figura 01: DNA a monte ea valle

Qual è la differenza tra il DNA a monte e verso il basso?

DNA a monte verso il basso verso il basso
La regione del DNA verso l'estremità 5 della sequenza codificante dal sito di inizio della trascrizione è conosciuta come DNA a monte.	La regione del DNA verso l'estremità 3 'del filo di codifica dal sito di inizio della trascrizione è conosciuta come DNA a valle.
Elementi
I promotori e gli amplificatori si trovano nel DNA a monte	Unità di trascrizione e le sequenze di terminatori si trovano nel DNA a valle.
Numerazione
Nucleotidi nella regione a monte sono indicati con numeri negativi	I nucleotidi vengono riferiti con numeri positivi.
Questa regione contiene elementi necessari per regolare e avviare la trascrizione
Questa regione contiene istruzioni per produrre una proteina e terminare la trascrizione	Riepilogo - Upstream vs DNA downstream

È facile identificare a monte e a valle di un filo di RNA. Per quanto riguarda il sito di riferimento, la regione verso l'estremità 5 'del filamento RNA è conosciuta come RNA a monte, mentre la regione verso l'estremità 3' è conosciuta come RNA a valle. Tuttavia, nel DNA, ci sono due fili che corrono in entrambe le direzioni 5 'a 3' e 3 'a 5'. Quindi, la differenza tra il DNA a monte e verso il basso è complicato. Pertanto, è differenziato con riferimento alla trascrizione di un gene. Dal sito di inizio della trascrizione verso l'estremità 5 del filo di senso, la regione del DNA è conosciuta come DNA a monte, mentre dal sito di iniziazione della trascrizione verso l'estremità 3 'del filo di senso è conosciuto come DNA a valle. Questa è la differenza tra il monte e il basso del DNA.

Riferimenti:

1. Rhee, Amy C., Benjamin H. Somerlot, Neeta Parimi e Jonatha M. Gott. "Ruoli distinti per le sequenze a monte ea valle dei siti di Physarumediting. "RNA. Cold Spring Harbor Laboratory Press, settembre 2009. Web. 18 marzo 2017

Immagine per gentile concessione:

1.Barbosa, Cristina, Isabel Peixeiro e Luísa Romão. "Regolamento dell'espressione di geni da strutture di lettura aperte a monte e malattie umane. "PLOS Genetica. Biblioteca pubblica della scienza, n. d. Web. 18 marzo 2017.