Differenza tra VNTR e STR | VNTR vs STR

Differenza chiave - VNTR vs STR

Gli studi sul DNA hanno un'immensa utilità nella comprensione e nella determinazione dei rapporti filogenetici, nella diagnosi delle malattie genetiche e nella mappatura dei genomi dell'organismo. Diverse tecniche associate all'analisi del DNA vengono utilizzate per identificare un determinato gene o una sequenza di DNA in un pool di DNA sconosciuto. Sono conosciuti come marcatori genetici. I marcatori genetici sono usati nella biologia molecolare per identificare la variazione genetica tra individui e specie. La ripetizione tandem numero variabile (VNTR) e la breve ripetizione tandem (STR) sono due tipi di marcatori genetici che mostrano il polimorfismo tra gli individui. Entrambi i tipi sono non codificanti DNA ripetitivo che sono tandem ripetizioni. Sono disposti in coda a coda nei cromosomi. VNTR è una sezione del genoma in cui viene ripetuta più volte la sequenza di nucleotidi brevi. STR è un'altra sezione del DNA all'interno del genoma che viene organizzata come unità ripetitive costituite da due o tredici nucleotidi in centinaia di volte. La differenza principale tra VNTR e STR è il numero di nucleotidi in una sequenza ripetuta. Le unità ripetitive di VNTR sono composte da 10 a 100 nucleotidi mentre l'unità ripetuta di STR è composta da 2 a 13 nucleotidi . VNTR e STR sono ampiamente utilizzati negli studi forensi.

SOMMARIO

1. Panoramica e differenza chiave

2. Che cosa è VNTR

3. Che cosa è STR

4. Somiglianze tra VNTR e STR

5. Confronto laterale - VNTR vs STR in forma tabulare

6. Riepilogo

Che cosa è VNTR?

Una ripetizione tandem è una breve sequenza di DNA che viene ripetuta in modo testa a coda in un determinato luogo locomotore cromosomico. Non c'è alcuna sequenza o nucleotide all'interno della ripetizione tandem. Ci sono diversi tipi di ripetizioni tandem nel genoma. VNTR è un tipo di ripetizione tandem tra loro che ha unità ripetute costituite da 10 a 100 nucleotidi. VNTR è un tipo di minisatellite. Queste ripetizioni tandem possono essere trovate in molti cromosomi. Sono intersperse nel genoma umano e sono localizzate prevalentemente nelle regioni subtelomeriche dei cromosomi.

I VNTR mostrano polimorfismo di ripetizione tandem tra gli individui. La lunghezza del VNTR in una particolare posizione del cromosoma è altamente variabile tra gli individui a causa della variazione del numero di unità ripetute organizzate in quella sezione del DNA. Pertanto, VNTR può essere utilizzato come strumento potente nell'identificazione di individui e l'analisi VNTR viene utilizzata in molti campi tra cui la genetica, la ricerca di biologia, la forensicità e la stampa a dito del DNA.VNTRs erano i primi marcatori genetici utilizzati per quantificare il trapianto di midollo osseo. VNTRs erano anche i primi marcatori polimorfi utilizzati nella profilatura del DNA nei forensi.

Figura 01: Variazione di VNTR in sei individui

L'analisi VNTR viene eseguita mediante polimorfismo di lunghezza del frammento di restrizione seguito da ibridazione del sud. Quindi, ha bisogno relativamente di un grande campione di DNA. L'interpretazione del profilo VNTR è anche problematica. A causa di queste limitazioni, l'uso di VNTR in genetica forense è stato limitato e viene sostituito da analisi STR.

Che cosa è STR?

STR è una sezione del DNA altamente ripetitiva che consiste in due o tredici nucleotidi ripetibili organizzati in modo tandem. STR è simile a VNTR. Ma varia da VNTR dal numero di nucleotidi in una sequenza ripetuta e dal numero di ripetizioni. STR è un tipo di microsatellite.

Analisi STR analizzata per misurare l'esatto numero di unità ripetitive. Le STR sono molto variabili tra gli individui, simili a VNT. I profili STR si differenziano da persona a persona. Pertanto, l'analisi STR è usata nella biologia molecolare per confrontare loci specifici sul DNA da due o più campioni. Di conseguenza, le STRs sono considerate potenti marcatori genetici nella biologia molecolare. Fornisce un ottimo strumento per identificare gli individui a causa del loro alto grado di polimorfismo e di una durata relativamente breve.

Attualmente, STR sono il più usato strumento di polimorfismo genetico analizzato nella genetica forense. La maggior parte dei casi di comportamento forense comporta un'analisi polimorfica STR. STR loci sono diffusi in tutto il genoma. Ci sono migliaia di STR situati nei cromosomi che possono essere utilizzati per l'analisi forense. L'analisi STR non comporta polimorfismo di lunghezza di restrizione come l'analisi VNTR. L'analisi STR non taglia il DNA con gli enzimi di restrizione. Sonde specifiche vengono utilizzate per associare le regioni desiderate al DNA e utilizzando la tecnica PCR, vengono determinate le lunghezze della STR.

Figura 02: variazione STR tra i campioni

Quali sono le somiglianze tra VNTR e STR?

VNTR e STR sono DNA non codificanti.

Entrambe le ripetizioni sono tandem.
Entrambi dimostrano il polimorfismo tra gli individui a causa della differenza nella lunghezza della sezione del DNA.
Entrambe sono utilizzate come marcatori genetici potenti nella stampa a dito del DNA e negli studi forensi.
Qual è la differenza tra VNTR e STR?

- VNTR vs STR

VNTR è un DNA ripetitivo non codificato che ha una breve sequenza di nucleotidi ripetuta in modo tandem.

STR è una sezione del DNA altamente ripetitiva che consiste in due o tredici nucleotidi ripetibili organizzati in modo tandem.
Dimensioni	I VNTR sono più grandi di STR.
STRs sono più piccole di VNTRs.
Numero di nucleotidi in sequenza ripetuta	L'unità ripetuta di VNTR è composta da 10 a 100 nucleotidi.
L'unità ripetuta di STR è costituita da 2 a 13 nucleotidi.
Sommario - VNTR vs STR	VNTR e STR sono due potenti marcatori genetici utilizzati nella biologia molecolare, in particolare nel campo della genetica forense.VNTR è un tipo di minisatellite e STR è un microsatellite. VNTR e STR sono non codificanti, DNA molto ripetitivi. Sono ripetizioni tandem. La struttura generale di VNTR e STR è la stessa. Tuttavia, il numero di nucleotidi nella sequenza ripetuta e nella lunghezza sono diversi. VNTR ha sequenze ripetute composti da 10 a 100 nucleotidi. STR ha sequenze ripetute costituite da 2 a 13 nucleotidi. Questa è la differenza tra VNTR e STR.

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Riferimenti:

1. "La scienza della genetica forense. "CRG - Consiglio per la genetica responsabile. N. p., n. d. Web. Disponibile qui. 10 luglio 2017.

2. "Analisi STR. "Wikipedia. Wikimedia Foundation, 22 marzo 2017. Web. Disponibile qui. 10 luglio 2017.

Immagine per gentile concessione:

1. "D1S80Demo" Da PaleWhaleGail in Wikipedia in lingua inglese (CC BY-SA 3. 0) via Wikimedia Commedia