Differenza tra Genoma e Exome | Genome vs Exome

Anonim

Differenza chiave - Genoma vs Exome

Il progetto genomico umano, iniziato nel 1911, è stato una rivoluzione nella storia della genetica moderna che ha dato origine a molte tecniche analitiche in termini di diagnosi genetica e terapia genica. Il progetto genomico umano è stato un programma di ricerca collaborativo basato su Stati Uniti, il cui obiettivo era la mappatura completa e la comprensione di tutti i geni degli esseri umani. Sulla base di questo progetto di ricerca, i termini Genoma, Intron e Exon sono stati sviluppati . Il geno è l'insieme completo di geni in un organismo che rappresenta tutti i geni presenti in quel particolare organismo , mentre Exome è l'insieme completo di esoni presenti in un organismo che conta tutte le regioni codificanti di geni presenti in una particolare specie. Questa è la differenza fondamentale tra genoma e exome.

SOMMARIO

1. Panoramica e differenza chiave

2. Che cosa è il Genoma

3. Che cosa è Exome

4. Somiglianze tra Genome e Exome

5. Confronto laterale - Genoma vs Exome in forma tabulare

6. Sommario

Che cosa è il Genoma?

Il genoma si riferisce al set completo di istruzioni genetiche che vengono memorizzate come geni o sequenze specifiche di acidi deossiribonucleici (DNA) in un particolare organismo o specie. Ogni genoma contiene tutte le informazioni necessarie per la crescita, lo sviluppo e altre attività funzionali di un organismo particolare. Il genoma è costituito da DNA che è nel nucleo degli eucarioti e nel citoplasma dei prokaryotes.

I codici genetici del genoma umano sono costituiti da 3,2 miliardi di basi di DNA che sono composti da quattro tipi di nucleotidi: adenina, guanina, citosina e timina. Diversi ordini sequenziali di queste quattro basi definiscono l'unicità di un determinato gene. Il genoma eucariotico comprende sia il DNA nucleare che il DNA mitocondriale. Così, questa combinazione unica differisce dall'organismo all'organismo e il genoma di un individuo è univoci in natura e può agire come impronta digitale per scopi diagnostici.

Il primo genoma sequenziato e identificato è quello di

Escherichia coli; in seguito, sono stati analizzati i lieviti, i protozoi e i genomi vegetali. Il sequenziamento del genoma umano ha preso un paio di decadi per il suo completamento. Il genoma umano contiene circa 3 200 000 000 nucleotidi, circa 30 000 a 40 000 geni codificanti e non codificanti e viene compattato in 23 paia di cromosomi che trasportano il DNA confezionato che funge da determinanti genetici.L'imballaggio del gene è il risultato delle strutture elicoidali del DNA fortemente torsione e della formazione di complessi associati alla proteina che riduce la lunghezza occupata dal DNA nella sua fase non compatta. Che cosa è Exome?

Exome è un sottoinsieme del genoma che consiste solo nelle regioni di codifica dei geni di un organismo particolare. Le regioni di codifica dei geni sono denominate come esoni e sono un tipo di geni che sono trascritti in mRNA e poi tradotti in sequenze di aminoacidi, dando luogo a proteine ​​funzionali e strutturali. Durante le modificazioni post-trascrizionali in eucarioti, gli introni che sono aree non codificanti vengono rimossi e gli esoni vengono uniti. Questo è fatto da un processo noto come splicing RNA. Nei prokaryotes non esistono più o meno introni; di conseguenza, non è necessaria l'aggancio RNA. Così, per generare l'esoma di un organismo particolare, si dovrebbe estrarre l'RNA maturo e quindi il DNA complementare dovrebbe essere sintetizzato usando enzimi di reversi transcriptasi.

Figura 02: Exome

Gli esoni di tutti i nostri geni compongono circa il 1,5% del genoma e contengono solo circa 3 megabasi poiché l'esomero rappresenta una piccola percentuale dell'intero genoma. È più conveniente e più veloce per sequenziare l'esome che l'intero genoma. L'analisi Exome fornisce importanti informazioni sulle proprietà funzionali di un organismo e le mutazioni osservate nell'exome sono direttamente correlate a una manifestazione clinica.

Quali sono le somiglianze tra Genoma e Exome?

Genoma e exome sono costituiti da una serie di geni in un organismo.

  • Entrambe contengono quattro basi principali di nucleotidi; Adenina, guanina, citosina e timina.
  • Genoma e exome sono condensati in cromosomi ed è disposta in modo estremamente compatto.
  • La sequenza di entrambi i genomi e l'exome può essere eseguita sotto
  • in vitro. Genoma e exome sono utili nell'analizzare le mutazioni genetiche che potrebbero essere il motivo delle malattie genetiche e di altre malattie non comunicabili e squilibri metabolici.
  • Qual è la differenza tra Genoma e Exome?

L'insieme completo di istruzioni genetiche memorizzate come geni o sequenze di DNA in un particolare organismo o specie è conosciuto come il genoma.

Un sottoinsieme del genoma che è costituito solo dai geni di codifica di un particolare organismo è noto come l'exoma.

Dimensione

Il genoma è grande, circa 3 200 000 000 nucleotidi. L'exoma è piccolo, circa 3 000 000 nucleotidi (1% del genoma).
Composizione
Il genoma è composto da un contenuto totale di DNA compresi codici e regioni non codificanti. Exome contiene solo regioni di codifica del DNA totale noto come esoni.
Sequencing
Metodi semplici come il sequenziamento di Sanger possono essere usati per sequenziare il genoma. Metodi complessi che includono la trascrizione inversa di mRNA maturo sono necessari per la sequenza di exome.
Sommario - Genome vs Exome
Il genoma è l'insieme completo di DNA presente in un organismo.Exome è una parte del genoma che include solo gli esoni dell'intero insieme di geni. Questa è la differenza di base tra genoma e exome. Sia l'analisi del genoma che dell'esomero è un campo di scienza in arrivo ed è molto utilizzato nelle tecnologie del DNA ricombinante per analizzare i geni presenti in un organismo e sviluppare metodi per manipolare i geni per essere utilizzati in maniera vantaggiosa. Scarica la versione PDF di Genome vs Exome

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Riferimenti:

1. "Una panoramica del progetto genomico umano. "National Human Genome Research Institute (NHGRI), disponibile qui. Accesso al 30 agosto 2017.

2. Brown, Terence A. "Il Genoma Umano. "Genomes. Seconda edizione., U. S. National Library of Medicine, 1 gennaio 1970, disponibile qui. Accesso al 30 agosto 2017.

3. "Crowdsourcing cura le tue condizioni. "Genos, disponibile qui. Accesso al 30 agosto 2017.

Immagine per gentile concessione:

1. "Human Human Genome Research Institute (NHGRI) di Bethesda, MD, Stati Uniti - Human Genome Project Timeline (CC BY 2. 0) via Commons Wikimedia