Differenza tra genotipizzazione e sequenziazione | Genotipizzazione vs sequenziazione
Differenza chiave - Genotipizzazione vs sequenziamento
Genotipizzazione e sequenziamento sono due tecniche eseguite per ottenere informazioni sugli acidi nucleici, principalmente DNA di un organismo. La differenza fondamentale tra la genotipizzazione e il sequenziamento è che la genotipizzazione è il processo di determinazione della variante genetica che l'individuo possiede utilizzando marcatori mentre il sequenziamento è la determinazione dell'ordine corretto della sequenza nucleotidica all'interno del dato frammento del DNA.
SOMMARIO
1. Panoramica e differenza chiave
2. Che cosa è Genotipizzazione
3. Che cosa è Sequencing
4. Confronto laterale - Genotipizzazione vs sequenziamento
5. Sommario
Che cosa è la Genotipizzazione?
La genotipizzazione è la determinazione del trucco genetico di un individuo usando una sequenza di DNA e marcatori e il confronto e l'identificazione della sua eredità. La genotipizzazione è importante per la biologia evolutiva, la biologia della popolazione, la tassonomia, l'ecologia e la genetica degli organismi. Può essere eseguito con tecniche diverse tra cui sequenza del DNA, reazione a catena di polimerasi, polimorfismo di lunghezza del frammento di restrizione (RFLP), rilevamento polimorfico amplificato casuale, polimorfismo di lunghezza frammentaria amplificata (AFLP), microarray di DNA, ecc. --2 ->
La genotipizzazione comporta il sequenziamento di particolari piccoli frammenti di sequenze di DNA e la ricerca della correlazione della composizione genetica con altri individui che utilizzano marcatori genetici. Determina i singoli polimorfismi nucleotidi (SNP) tra gli individui o gli alleli specifici. La genotipizzazione è applicabile a una vasta gamma di organismi tra cui gli esseri umani. È anche applicabile a microrganismi come virus, funghi ecc. E possono essere utilizzati per determinare le loro varianti genetiche con i profili di riferimento. Nell'epidemiologia molecolare e nella microbiologia forense, il controllo degli agenti patogeni, in particolare dei microrganismi, è fatto dalle informazioni ottenute dalla genotipizzazione. La genotipizzazione è molto importante nell'analisi pedigree. Gli esseri umani sono genotipizzati per confermare la maternità e la paternità. Il genotipo rivelerà gli alleli dominanti e recessivi di geni che decidono caratteristiche specifiche.
Che cosa è la sequenza?
La sequenziazione è il processo di determinazione dell'ordine corretto del nucleotide in un determinato frammento di DNA o RNA. Praticamente tutte le informazioni necessarie per la crescita e lo sviluppo di un organismo sono codificate nel suo genoma. La disponibilità di tecniche per la produzione e la separazione di poche centinaia di nucleotidi lunghi frammenti di acidi nucleici ha portato allo sviluppo di procedure di determinazione dell'esatta sequenza nucleotidica di un determinato frammento di DNA o RNA.Oggi sono disponibili diversi metodi di sequenziamento. Questi metodi di sequenziamento, insieme alle tecnologie per la costruzione di librerie genomiche che rappresentano l'intero genoma di un organismo, facilitano il sequenziamento dell'intero genoma di tale organismo, effettuando analisi approfondite di strutture geniche, funzioni geniche, posizioni gene, espressioni genetiche, mapping gene, regioni di regolazione del gene ecc.
Sono stati sequenziati e mappati i genomi totali di molti virus, diversi batteri, archaebatteri, lieviti e molti altri organismi. Il progetto del genoma umano ha reso possibile sequenziare e mappare l'intero genoma umano e pubblicare il suo primo progetto nel 2003. È una pietra miliare nel progresso della biologia. Le sequenze del genoma umano sono ora utilizzate nel settore medico per identificare le cause genetiche per le malattie rare, il rischio di malattie dello schermo nei neonati, identificare i dettagli genetici di diversi tipi di cancro, sviluppare nuove terapie e sviluppare nuovi strumenti diagnostici.
Nel mondo delle piante, il genoma del riso e i genomi Arabidopsis sono stati sequenziati. La conoscenza di queste sequenze senza dubbio rivoluziona la nostra comprensione di come funzionano le cellule e gli organismi.
Figura2: Un autoradiografo di sequenza di sangue
Qual è la differenza tra Genotipizzazione e Sequencing?
Genotipizzazione è il processo di determinazione della composizione genetica di un individuo e del controllo del gruppo o della tassonomia di quell'organismo.
La sequenziazione è il processo di determinazione dell'ordine preciso dei nucleotidi di un determinato frammento di DNA o RNA.
Tecniche |
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| RFLP, sequenza di geni, PCR, microarray di DNA, AFLP ecc. | sequenziamento di Sanger, sequenziamento di Gilbert, Pyrosequencing, sequenziamento di prossima generazione, sequenziamento di fucile, ecc. |
| Concorrenze maggiori | |
| preoccupato se le differenze di genotipo stiano dando le differenze effettive del fenotipo. | Questo è più preoccupato per l'ordine dei nucleotidi e le sue differenze e i cambiamenti con altri organismi. |
| Sommario - Genotipizzazione vs sequenziamento | |
| Genotipizzazione e sequenziamento sono utili per studiare l'informazione genetica degli organismi. La genotipizzazione è il processo di determinazione delle variazioni genotipiche tra gli individui e la ricerca delle loro categorie. La sequenziazione è il processo di determinazione dell'ordine corretto dei nucleotidi nel frammento interessato o nella regione del DNA. Entrambe le tecniche forniscono importanti informazioni sui geni e sui genomi. | Riferimento: |
1. "Metodi di genotipizzazione. "Metodi in biologia molecolare (Clifton, N. J.). U. S. Biblioteca Nazionale di Medicina, n. d. Web. 20 feb. 2017.
2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin e M. D. Shriver. "Analisi della curva di fusione di SNP (McSNP ): Un approccio senza gel e poco costoso per la genotipizzazione SNP. "BioTechniques 30, 2 (2001): 358-67. Web.
Immagine gentile:
1. "Genotyping RFLP" Da (sconosciuto) - Istituti Nazionali di Salute (Public Domain) via Commons Wikimedia
2."Fluorescenza radioattiva" da Abizar in Wikipedia (CC BY-SA 3. 0) tramite Wikimedia Commons Wikimedia
