Differenza tra il segnalatore selezionabile e il gene del reporter | Selectable Marker vs Reporter Gene

Differenza chiave - Marker selezionabile vs Gene Reporter

La tecnica di ingegneria genetica viene utilizzata per trasferire importanti geni dall'organismo ad un altro organismo. Inserendo un gene straniero nel genoma di un altro organismo e facendolo esprimere all'interno della cellula ospite sono passi più difficili nel trasferimento del gene. Per rilevare il successo del processo di trasformazione, nella molecola ricombinante viene utilizzato un marker selectable e un gene reporter. Un marker selectable è una sequenza di DNA o un gene che esprime e seleziona le cellule trasformate dalle cellule non trasformate. Un gene reporter è un altro gene che viene utilizzato per distinguere le cellule trasformate e per quantificare o rilevare come il gene inserito funzioni all'interno dell'host. La differenza fondamentale tra marcatore selectable e reporter gene è che il marcatore selectable viene utilizzato per esaminare le cellule non trasformate e per segnalare le cellule trasformate mentre il gene reporter viene utilizzato per quantificare il livello di espressione genica all'interno dell'host.

SOMMARIO

1. Panoramica e differenza chiave

2. Che cosa è Marker selezionabile

3. Che cosa è Reporter Gene

4. Confronto Side By Side - Marker selezionabile vs Reporter Gene

5. Sommario

Che cosa è un Marker selezionabile?

Nell'ingegneria genetica, il gene di interesse viene inserito in un vettore adatto e trasformato in organismi ospitanti. Tuttavia, la trasformazione ha successo solo nelle cellule ospitanti competenti e c'è la possibilità che le cellule ospitanti rifiutino l'assunzione di DNA straniero. Pertanto, la differenziazione delle cellule trasformate e non trasformate è importante per continuare con ulteriore sperimentazione. Quindi, i ricercatori incorporano un gene marcatore selectable al vettore per una facile selezione delle cellule trasformate da cellule non trasformate. Un marcatore selectable è una sequenza di DNA, in particolare un gene utile nell'identificazione delle cellule trasformate. Questo gene marcatore presenta un tratto che si adatta a una selezione artificiale di cellule trasformate da cellule non trasformate su un supporto.

I marcatori selettivi più comuni utilizzati nella biologia molecolare sono geni resistenti agli antibiotici. Un gene di resistenza agli antibiotici viene inserito nel vettore e trasformato in cellule ospite in modo particolare al batterio ospite. Quel particolare antibiotico è incorporato nel mezzo di coltura del batterio. A causa della presenza del marcatore selettivo, alle condizioni selettive, solo le cellule che contengono l'apposito marker selettivo possono sopravvivere.Le cellule non trasformate non sono in grado di crescere nel mezzo contenente antibiotici. Pertanto, a causa del marker selectable che è resistente agli antibiotici, le cellule trasformate sono facilmente identificabili.

Geni che conferiscono caratteristiche per antimetaboliti, gli erbicidi vengono utilizzati come marcatori selettivi in ​​vettori di clonazione nell'ingegneria genetica delle piante. Tuttavia, questa cotransformazione di marcatori selettivi in ​​organismi geneticamente modificati ha effetti negativi sull'ambiente e sull'uomo. Il rilascio di batteri antibiotici resistenti può aumentare la resistività antibiotica dei patogeni umani. Può contaminare il prodotto o la biomassa da antibiotici e può perdere la pressione selettiva come conseguenza del degrado e dell'inattivazione degli antibiotici.

Figura 01: Il vettore plasmidico per il trasferimento genico con marcatore selettivo

Che cosa è un gene del reporter?

I geni del Reporter sono geni che consentono di rilevare o misurare l'espressione genica inserita. Questi geni del reporter possono essere associati a sequenze di regolazione del gene di interesse per segnalare la posizione oi livelli di espressione. Pertanto, durante l'espressione di geni sotto lo stesso promotore, essi vengono trascritti in una singola sequenza mRNA e poi tradotti in una proteina che può indicare il livello di espressione genica.

I geni del Reporter sono di vario tipo e contengono caratteristiche visivamente identificabili che di solito sono coinvolte in proteine ​​fluorescenti e luminescenti. I geni che codificano la proteina fluorescente e gli enzimi, convertono substrati invisibili a prodotti luminescenti o colorati, segnalando l'espressione genica di successo e dando la possibilità di quantificare l'espressione genica.

Figura 02: Expression Gene Express

Qual è la differenza tra Marker Selectable e Reporter Gene?

- diverso articolo prima della tabella ->

Marker selezionabile vs Reporter Gene

Marker selezionabile è una sorta di sequenza di DNA che aiuta a distinguere le cellule trasformate con le cellule non trasformate.
Il gene Reporter è un gene che aiuta a quantificare l'espressione del gene desiderato inserito nella cellula ospite.	Natura delle unità prodotte
I geni sono codificati con caratteristiche che aiutano nella selezione artificiale sui supporti in crescita.
I geni sono codificati con caratteristiche visivamente identificabili.	Uso
I geni di resistenza agli antibiotici, i geni antimetaboliti, i geni di resistenza agli erbicidi, ecc. Sono esempi di marker selectable.
Gli esempi di geni per proteine ​​fluorescenti verdi, β-glucuronidasi, Chloramphenicol acetiltransferasi, Red fluorescente proteine, ecc.	Sommario - Marker selezionabile vs Gene Reporter

Marcatori selezionabili consentono alle cellule trasformate di crescere in supporti selettivi dosati con particolare antibiotico o herbicide. Sono utilizzati per la selezione precoce di cellule trasformate. I geni del reporter vengono utilizzati per quantificare il livello di espressione del gene desiderato inserito. Essi consentono anche la differenziazione delle cellule trasformate e non trasformate. Questa è la differenza tra marcatore selectable e gene reporter.Sia il marcatore selettivo e il reporter gene sono considerati marcatori importanti nell'ingegneria genetica.

Riferimenti:

1. Ziemienowicz, Alicja. "Markers selezionabili vegetali e geni del reporter. “SpringerLink. Springer-Verlag, n. d. Web. 23 marzo 2017.

2. Shih, Chen-Han, Hsiao-Yin Chen, Hung-Chieh Lee e Huai-Jen Tsai. "Il gene della porcellana cromoproteina viola come nuovo indicatore di selezione per la transgenesi della microalga Nannochloropsis oculata. "PLOS ONE. Biblioteca pubblica della scienza, n. d. Web. 25 marzo 2017

Immagine per gentile concessione:

1. "Plasmide con inserto" Di Michael Jeltsch - Il lavoro personale (CC BY-SA 4. 0) via Wikimedia Commedia

2. "Reporter gene" Da TransControl in en. wikipedia (CC BY-SA 3.0) tramite Wikimedia Commons